Если после выполнения квеста «Возвращение сумерек» добавить себе в инвентарь консолью Скелетный ключ — он будет ломаться как и обычнаяотмычка, хоть и не будет пропадать при этом.

Там кто то в другой теме скелетный ключ сломал, так что не советую носить его без отмычек.

А то мало ли... 

Почему этот ключ не открывает ВСЕ двери, в том числе и плиты для которых требуются драконьи когти? Казалось бы вот оно счастье чудо вещь открывающая всё на свете и тут на тебе - закрытая дверь, требующая ключ... Но у меня же есть чудо отмычка! Нет, всё равно дверь закрыта и без ключа не откроется и квестовому замку абсолютно плевать на скелетный ключ. Не по канону господа.

Видимо так решили разработчики, если бы отмычкой можно было открыть все подряд было бы не интересно

вспомните форму скелетного ключа и форму скважины для драконьего когтя. это все равно что тамбурным ключом пытаться открыть сейф.

Тем не менее, Мерсер смог открыть дверь в Снежной Завесе без когтя. 

Добавила консолью скелетный ключ, после квеста Ослепление у меня 2 ключа, как удалить тот что я добавила?

player.removeitem 3A070 1

Ну что значит "не по канону"?! Что по канону, а что нет - решать разработчикам. 

Ключ - младший даэдрот, подданый Ноктюрнал. Если хозяйка не захочет, чтобы он что-то открыл (будь это хоть шпингалет на деревенском сортире), то он и не откроет - вот Вам и весь канон.

А если она не против, то и форма скважины тут значения не имеет, коль скоро он даже с магическим образом запертыми дверями может помочь справится.

Не забывайте, он с этим Ключом провёл 25 лет, после чего не то что "когтистые" двери открыть мог, все три абилки Соловьёв были доступны.